关于新冠病毒变体需要知道的8件事
来自世界各地的突变(以及一些美国本土的菌株)提醒我们,我们还没有走出大流行的森林。
近2年值得庆幸的是,我们目前的疫苗品种对德尔塔病毒的抵抗很顽强。目前,美国90%以上的病例都是德尔塔病毒造成的,在美国特定地区的比例甚至更高。例如,在爱荷华州、堪萨斯州、密苏里州和内布拉斯加州,这个数字现在高达98%,而在北达科他州和南达科他州、科罗拉多州、蒙大拿州、犹他州和怀俄明州,这个数字超过了95%。
随之而来的是紧迫的新问题,因为事实证明,德尔塔病毒的传染性和致命性更强,尤其是在未接种疫苗的人群中,尽管它对年轻人和儿童的影响似乎比最初的病毒更严重。这意味着这场危机还没有结束。
最初命名为他们的原产地并分配相应的数字,来自世界各地的新菌株现在希腊letters-Alpha命名,β,等让他们更容易区分,并避免诋毁一个特定国家或人,决定由世界卫生组织5月31日。
我们对这些变体有很多疑问,所以我们向顶级流行病学家寻求答案。以下是你需要了解的关于德尔塔和其他新型冠状病毒的所有信息,以及它们值得关注的原因。
1.德尔塔病毒更具传染性和致命性,是美国近期病例激增的原因。
Delta,又名B.1.617.2,是2020年12月在印度首次出现的一种变体,今年春天在印度迅速崛起,然后迅速进入美国,并在这里迅速蔓延。它被称为双突变体这意味着它含有至少两种原SARS-CoV-2病毒刺突蛋白的突变。(它实际上总共包含13个突变。)
截至8月初,包括美国在内的130个国家都报告了德尔塔变种。它已经取代阿尔法毒株成为美国主要的新冠病毒变种,占美国新冠病毒感染的93%左右。德尔塔病毒的独特之处在于它在年轻人中的流行,传播高峰发生在12至20岁的人群中。
美国国家过敏和传染病研究所主任安东尼·福奇医学博士表示,德尔塔是美国消除COVID-19的“最大威胁”,特别是对那些出于任何原因仍未接种疫苗的人。请记住,这包括所有12岁以下的儿童,他们在美国还没有资格接种疫苗。随着学年即将到来(在一些州已经开始了),加上一些州取消了掩蔽要求,这可能是一个令人不安的组合。美国疾病控制和预防中心(CDC)和美国儿科学会都呼吁在2021年至2022学年对2岁及以上的儿童普遍戴口罩。
德尔塔病毒如此可怕的一个原因是它的传染性——根据CDC的一份内部文件,它的传染性比普通感冒、流感甚至可能是水痘都强。该文件帮助官员在2021年7月做出决定,恢复对每个人的口罩建议,包括那些接种过疫苗和未接种疫苗的人,在人群中以及在病例高和大量地区的室内和室外。(看看这个美国新冠疫情热点地图)
最近的一项研究发现,Delta病毒感染的病毒载量比首次检测到该病毒时的早期毒株高出1000倍。幸运的是,最新的研究表明,疫苗确实可以预防德尔塔病毒变种,而且它们对住院(目前约97%的住院患者未接种疫苗)和死于COVID提供了似乎很好的保护。但是,单剂量(即连续两次注射)的mRNA vax可能不足以起到足够的保护作用。
Pfizer-BioNTech,背后的公司第一信使核糖核酸疫苗(现在改名为“Comirnaty”)由美国食品和药物管理局批准,宣布加强注射可能是必要的对于所有以色列的人口数据后显示,抗体可能会略有减弱仅6个月后接受第二次接种疫苗。目前,疾病预防控制中心和食品药品管理局表示,其他健康的美国人不需要助推器。然而,在2021年8月12日,FDA批准给免疫抑制人群注射第三针疫苗,这些人群是最脆弱的,因为他们在接种两剂疫苗后无法有效地产生对抗病毒的抗体。疾控中心迅速效仿,现在正式推荐以下人群注射第三针:
任何接受肿瘤或血液癌症积极治疗的人
器官移植受者
在过去两年内接受过干细胞移植的患者
那些正在服药抑制免疫系统的人
中度至重度原发性免疫缺陷患者
任何艾滋病毒感染晚期或未经治疗的人
正在接受大剂量皮质类固醇或其他药物治疗的患者,可能会抑制免疫反应
如果你不确定是否应该打第三针,向你的医生寻求指导。
2.也不要排除阿尔法。
阿尔法菌株去年秋天在英国首次被发现,在达美航空袭击美国之前,阿尔法菌株是美国的主要菌株。2020年9月,科学家在英格兰东南部通过基因测序(一种用于跟踪病毒变化和突变的程序)发现了这种COVID变体,即B.1.1.7。截至2021年4月,美国所有50个州以及世界各地的许多其他地方都发现了这种病毒。科学表明,Alpha变种的传染性比之前的COVID-19菌株高50%,总体上导致更多病例和住院治疗。然而,目前的mRNA疫苗对它的疗效远远高于对Delta变种。
3.Beta, Gamma和EEK也引起了关注。
2020年12月18日,在阿尔法毒株的消息传出后,南非宣布正在处理一种类似的新变种COVID-19,称为B.1.351,或β.与此同时,另一种来自巴西的菌株被称为P.1γ自去年12月在该国传播后,于1月12日被发现。另外,在日本,尖峰突变E484K(昵称为“EEK”)在东京一家医院近70%的COVID患者中发现这种病毒后敲响了警钟。EEK本身并不是一种变体,但在日本、英国、南非、巴西和纽约的变体中存在一种变异——包括我们在这里讨论的许多超传染性变体。EEK被称为“逃逸突变”,它帮助病毒通过我们的免疫防御,并可能规避我们目前的单克隆抗体治疗方案。(跳到第7条了解更多。)
理论上,这些快速进化的病毒突变并不奇怪。凤凰城的感染预防流行病学家、美国科学家联合会COVID-19工作组成员Saskia Popescu博士说:“病毒突变很常见,也在意料之中。”作为一种活的有机体,病毒会自然地适应和变化——就像流感每年都会发生变异一样。事实上,COVID变体已经存在了几个月,帮助科学家跟踪病毒在世界各地的传播。
波士顿塔夫茨医学中心的传染病医生和医院流行病学家希拉·多伦博士解释说,这些菌株之所以受到广泛关注,是因为它们似乎是由于“与人类呼吸细胞结合的刺突蛋白的变化”而传播得更多。“这是令人担忧的。它比其他正常变异更紧密,这表明它更容易进入细胞。”
4.本土变体出现了。
美国出现的几种新冠病毒突变正在引起科学界的一些担忧。
ε
ε(也被称为CAL.20C或B.1.429/B.1.427)是2020年11月左右出现的California的变体。截至早春,该州至少有三分之一的COVID病例是由它造成的,而且它还蔓延到了美国的其他地区。美国疾病控制与预防中心(CDC)将这种突变正式归类为“关注的变异”,因为它的传染性高出20%,而且对抗体或疫苗疗法显示出耐药性。
极微小
另一种变体,去年11月起源于纽约地区,被称为极微小(或B.1.526)。目前,该地区的冠状病毒病例中至少有25%是这种病毒,而且可能更多。CDC将此列为“关注变量”(比“关注变量”低一级),引用潜在的对可用治疗方案的抵抗力。这种变种与β和γ毒株(以及可怕的“EEK”突变)具有相似的特征,因此科学家们正在观察它是否更致命,是否可能导致疫苗的效力降低,尽管需要进行更多的研究来证实这一点。
COH.20G / 501 y和COH.20G / 677 h
另一对变异(COH.20G y / 501和COH.20G / 677 h)于1月19日在俄亥俄州被发现,尽管疾病预防控制中心还没有将它们列为优先级。目前尚不清楚这些变异的具体情况,但它们的基因组成与阿尔法和贝塔菌株相似,这意味着它们可能具有额外的传染性。
病毒依靠被感染的宿主(在SARS-COV-2的情况下是人类)生存和复制。由于病毒在受感染的人体内复制时,会发生突变和产生新的变异,因此防止新变异出现的唯一方法就是阻止感染的传播。如果传播继续下去,更多的变种——无论是国产的还是国外的——将成为现实。
5.你可能不知道你是哪一种。
大多数,但不是全部,现有的快速和即时检测(PCR)方法用于检测较新的毒株。(1月8日,FDA发布了一项警告,警告三种不同品牌的PCR检测可能会在Alpha变体的情况下给出假阴性结果。)但并不是所有人都能分辨出新变种和旧毒株之间的区别——它们可能只是提供了积极的结果,特别是如果你认为你已经接触了病毒,但没有症状。根据新闻报道,这种情况在新的德尔塔变种中尤其明显。
多伦博士解释说,有时PCR检测可以根据一个人的基因编码的特定部分提供线索,以判断他们是否有新的变异。但要确定你感染的是哪种病毒,科学家需要做基因测试。对我们大多数人来说,这是不可能的。
6.针对新变种的疫苗有效性正在测试中。
好消息是:虽然在完全vaxxed的个体中报告了一些“突破性”病例,但越来越多的证据表明,两种mRNA疫苗(Comirnaty和Moderna)在很大程度上都可以防止因所有现有形式的新冠病毒(包括含有EEK spike蛋白突变的变体)住院治疗和死亡。
二月的一项研究自然界发现辉瑞公司最近获得FDA批准的疫苗可以预防新冠病毒-19的α和β株,另一份2月份的报告来自新英格兰医学杂志确认Comirnaty vax能抵抗伽玛变种。然而,最近的两项研究似乎提供了一些矛盾的报告;来自以色列的一项观察性研究(尚未经过同行评审)似乎表明,辉瑞公司的疫苗对德尔塔变种的效果可能不如之前认为的那么好,呼吁对所有人进行“加强注射”。与此同时,在英国进行的一项临床试验(比观察性研究更严格),经过同行评审并发表在新英格兰医学杂志8月中旬,研究表明,在阿尔法变异人群中,两种剂量(按建议;不是一种)的Comirnaty的有效性为93.7%,在德尔塔变异人群中为88.0%。
8月底,疾病预防控制中心发布数据证实了这一事实,表明尽管自Delta变异成为主流以来,疫苗预防感染的能力有所下降,但它们对严重症状仍然有效,在六个月的时间内,除患有潜在疾病的老年疗养院居民以及免疫抑制患者外,所有人因Delta variant holding公司而住院的估计有效性约为95%。
外卖吗?美国疾病控制与预防中心声称,由于Comirnaty和Moderna的原因,疫苗接种是保护自己免受所有新型COVID-19变异的最好方法做反对三角洲。
强生公司的单针腺病毒疫苗于2月27日获得FDA批准(但在美国官员调查了疫苗接种后罕见的血凝报告后,该疫苗被短暂暂停,并于4月恢复),在不同国家显示了针对中度和重度疾病的一系列疗效。其中,美国72%,拉丁美洲66%,南非57%。专家怀疑,巴西伽马毒株和南非贝塔毒株的优势可能是这些国家疫苗效力较低的原因。据报道,尽管强生公司的疫苗在南非的疗效降低,但该国现在选择了它,而不是阿斯利康的候选疫苗(美国尚未推出),后者对Beta毒株的保护似乎更少。
7.一些抗体治疗可能对某些变体无效。
令人担忧的是,研究表明,单克隆抗体治疗(模拟免疫系统,帮助对抗有害抗原,包括病毒的实验室制造的蛋白质)可能对这些新突变的一些不起作用。2021年1月的一项研究细胞宿主和微生物这表明β变体可能能够逃避免疫系统中的抗体的检测,因为它在结合呼吸细胞的刺突蛋白上发生了特异性突变。
根据美国疾病控制与预防中心的数据,Beta和Gamma变种都显示对一种特定抗体组合的敏感性降低:bamlanivimab和etesevimab。Alpha变体对这种单克隆抗体治疗仍有反应,而某些其他变体(不包括Delta)对单克隆抗体治疗仍有不同且未知的反应。最后,2021年7月发表的一篇文章自然,加上疾控中心最近的数据,表明班拉尼单抗和埃替西单抗可能是在对Delta变种有效,而Regeneron单克隆抗体似乎仍然有效。
要旨这些新变种中的许多似乎能够在某种程度上抵抗抗体疗法,尽管我们不知道这造成的危险的全部程度。科学家们仍在努力寻找答案。
8.你可以保护自己免受新菌株和“突破性”感染。
回到“突破性”感染,即完全接种疫苗的人仍然感染COVID - 19,主要是德尔塔COVID。美国疾病控制与预防中心说,相比之下,这些感染是罕见的,当你看有多少人接种疫苗和有多少突破性病例报告,到目前为止。截至7月底,在38个州已经有125682例突破性病例,占美国全面接种疫苗的1.65亿人的0.08%。不到0.001%的突破性感染患者(1507人)已经死亡,不到0.005%的患者(7101人)因COVID-19住院。
简言之,这些疫苗正在发挥它们设计的作用:防止死亡和病毒的严重后果。专家们知道并预测,疫苗永远不会对感染新冠病毒提供100%的保护,特别是对于像Delta这样的高传染性变种(还记得这种毒株的病毒载量更高吗?)。这就是为什么戴口罩和保持社交距离等其他保护措施现在变得更加重要的原因。
波佩斯库博士说:“传播途径没有改变,因此我们的干预策略仍然有效,现在比以往任何时候都更需要。”。因此,在室内(以及在人群中的室外)始终佩戴优质口罩,并在高度和大量扩散的区域与他人保持6英尺(或更长)的距离。
虽然这些变异可能更具有传染性,但它们不会传播任何不同的比现有的其他毒株都强“它不会改变你的呼吸道分泌物在空气中的传播方式,[和]这不会改变唾液穿过口罩的可能性,”多伦博士说。“问题只是,当你接触到这种病毒时,需要多少,或者这种病毒会让你生病的可能性有多大?”为了防止感染,现在是时候继续做我们已经做了好几个月的事情了:隔离,限制与他人的接触,小心旅行,至少在你完全接种疫苗并可以戴口罩之前。
不管有没有这些新的变异,我们仍然深陷这场大流行之中,我们都需要继续尽自己的一份力量。“我们每天失去数千人,我们绝对需要投入巨大的努力,优先为尽可能多的人接种疫苗,”多伦博士补充说。“现在是时候采取比以往任何时候都多的措施来防止感染的传播了。”
-来自Sarah Ellis的原始报道
新COVID变体:疾病控制和预防中心。(2021),“新的冠状病毒变体。”https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/transmission/variant.html
美国不同案例地图:疾病控制和预防中心(2021)“变体情况。”https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/transmission/variant-cases.html
UK Strain, Scientific Brief:疾病控制和预防中心。(2020年),“中期:新出现的SARS-CoV-2变异VOC 202012/01的影响。”https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/scientific-brief-emerging-variant.html
英国菌株,死亡率增加:自然界.(2021年)“社区检测的SARS-CoV-2谱系B.1.1.7的病例死亡率增加。”https://www.nature.com/articles/s41586-021-03426-1
新冠肺炎毒株:病毒学。(2021)“玛瑙斯突发性SARS-CoV-2谱系的基因组特征:初步发现”。https://virological.org/t/genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-manaus-preliminary-findings/586
俄亥俄州的新冠病毒菌株:bioRxiv。(2021年)“在俄亥俄州哥伦布市的临床样本中出现了包括N501Y在内的SARS-CoV-2尖峰变异的明显模式。”https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.01.12.426407v2
加州的新冠病毒菌株:《美国医学会杂志》.(2021年)“南加州出现了一种新型SARS-CoV-2变种”。https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2776543
新冠肺炎的纽约毒株:bioRxiv。(2021年)“在纽约地区出现的SARS-CoV-2谱系B.1.526被用于查询突变峰的软件实用程序检测到。”https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.02.14.431043v2.full.pdf
新冠肺炎的纽约毒株:medRxiv。(2021年)“一种新型SARS-CoV-2担忧变体,B.1.526,在纽约发现”。https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.02.23.21252259v1
COVID变异比例:疾病控制和预防中心。(2021),“美国的不同比例。”https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-proportions.html
关注的新冠病毒变异:疾病控制和预防中心(2021)“SARS-CoV-2变异分类和定义”。https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-updates/variant-surveillance/variant-info.html
辉瑞疫苗对突变的有效性:大自然。(2021)“用BNT162b2疫苗诱导血清中和N501Y突变型SARS-CoV-2。”https://www.nature.com/articles/s41591-021-01270-4
Moderna疫苗对突变的效果:现代化。(2021年)“Moderna COVID-19疫苗对首次在英国和南非共和国发现的新变异保持中和活性。”https://investors.modernatx.com/news-releases/news-release-details/moderna-covid-19-vaccine-retains-neutralizing-activity-against
阿斯利康疗效数据:牛津大学。(2021),“牛津冠状病毒疫苗在第二次注射前的3个月间隔内显示出76%的持续保护。”https://www.ox.ac.uk/news/2021-02-02-oxford-coronavirus-vaccine-shows-sustained-protection-76-during-3-month-interval
阿斯利康临床试验数据:阿斯利康。(2021年)“AZD1222美国III期临床试验在中期分析中达到了预防COVID-19的主要疗效终点。”https://www.astrazeneca.com/content/astraz/media-centre/press-releases/2021/astrazeneca-us-vaccine-trial-met-primary-endpoint.html
FDA对假阴性的警告:食品和药物管理局。(2021),“FDA向卫生保健提供者和临床实验室工作人员发布有关SARS-CoV-2病毒突变的警报。”https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/fda-issues-alert-regarding-sars-cov-2-viral-mutation-health-care-providers-and-clinical-laboratory
南非变体,抗体治疗:细胞宿主和微生物。(2021)“逃脱抗体识别的SARS-CoV-2刺突受体结合域突变的完整图谱”。https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1931312820306247
食品及药物管理局欧洲大学协会:食品和药物管理局。(2021).“FDA对第三种COVID-19疫苗发出紧急使用授权。”https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/fda-issues-emergency-use-authorization-third-covid-19-vaccine
强生疗效数据:强生公司。(2021).“强生公司宣布,在其3期ENSEMBLE试验的中期分析中,单剂杨森COVID-19候选疫苗达到了主要终点。”https://www.jnj.com/johnson-johnson-covid-19-vaccine-authorized-by-u-s-fda-for-emergency-usefirst-single-shot-vaccine-in-fight-against-global-pandemic
强生分销计划:强生公司。(2021).强生公司宣布向美国食品和药物管理局(FDA)提交申请,要求批准其单针杨森COVID-19候选疫苗的紧急使用。https://www.jnj.com/johnson-johnson-announces-submission-of-application-to-the-u-s-fda-for-emergency-use-authorization-of-its-investigational-single-shot-janssen-covid-19-vaccine-candidate
英国和南非的变体和抗体治疗:自然界.(2021)“SARS-CoV-2变种B.1.351和B.1.1.7的抗体抗性”。https://www.nature.com/articles/s41586-021-03398-2
巴西变体和抗体治疗:bioRxiv。(2021年)“巴西P.1型SARS-CoV-2毒株的抗体逃逸。”https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.03.12.435194v1
E484K突变:BMJ。(2021年)《Covid-19: E484K突变及其带来的风险》。https://www.bmj.com/content/372/bmj.n359
南非菌株和辉瑞的效果:medRxiv。(2021年)“有证据表明,在接种BNT162b2 mRNA的个体中,SARS-CoV-2担忧变异的突破率增加。”https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.04.06.21254882v1
Delta版本更新,2021年6月:白宫。2019冠状病毒病新闻发布会;2021年6月8日。”https://www.whitehouse.gov/wp-content/uploads/2021/06/COVID-Press-Briefing_8June2021_for-transcript.pdf
关于三角洲的Fauci陈述:CNBC。(2021),“新冠病毒-19应答。”https://www.cnbc.com/video/2021/06/22/dr-anthony-fauci-delta-variant-is-the-greatest-threat-to-eliminating-covid-19.html
有多少个国家有Delta:世界卫生组织。(2021),“西太平洋地区所有医护人员均可获得新冠病毒-19疫苗。”https://www.who.int/westernpacific/news/detail/06-08-2021-covid-19-vaccines-available-for-all-healthcare-workers-in-the-western-pacific-region
AAP对学校的口罩建议:美国儿科学会。(2021年)“美国儿科学会更新2021年秋季开学的建议。”https://services.aap.org/en/news-room/news-releases/aap/2021/american-academy-of-pediatrics-updates-recommendations-for-opening-schools-in-fall-2021/
疾控中心建议学校佩戴口罩:疾病控制和预防中心(2021年)《K-12学校COVID-19预防指南》https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/community/schools-childcare/k-12-guidance.html
CDC关于病毒的内部文件:《华盛顿邮报》。(2021年)“阅读:CDC关于突破性感染的内部文件。”https://www.washingtonpost.com/context/cdc-breakthrough-infections/94390e3a-5e45-44a5-ac40-2744e4e25f2e/?_=1
美国疾病控制和预防中心传播地区地图:疾病控制和预防中心(2021年)“按州、地区和管辖划分的美国COVID-19病例、死亡和实验室检测(NAATs)”https://covid.cdc.gov/covid-data-tracker/#cases_community
Delta的病毒载量:MedRxiv。(2021年)“由德尔塔SARS-CoV-2变种引起的大规模疫情中的病毒感染和传播。”https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.07.07.21260122v1
接种疫苗入院:美国国家公共电台。(2021年)“97%因COVID-19进入医院的人没有接种疫苗。”https://www.npr.org/2021/07/16/1017012853/97-of-people-entering-hospitals-for-covid-19-are-unvaccinated
辉瑞生物技术和德尔塔:英国公共卫生。(2021年)“新型冠状病毒疫苗对Delta (B.1.617.2)变异患者住院的有效性”。https://khub.net/web/phe-national/public-library/-/document_library/v2WsRK3ZlEig/view_file/479607329
FDA OK在某些人群中的助推器:美国食品和药物管理局。(2021年)“冠状病毒(COVID-19)更新:FDA批准为某些免疫功能低下的个人提供额外疫苗剂量。”https://www.fda.gov/news-events/press-announcements/coronavirus-covid-19-update-fda-authorizes-additional-vaccine-dose-certain-immunocompromised
有多少突破案例:NBC新闻。(2021年)“突破性的Covid病例:数据显示有多少接种过疫苗的美国人检测呈阳性。”https://www.nbcnews.com/health/health-news/breakthrough-covid-cases-least-125-000-fully-vaccinated-americans-have-n1275500
突破性案例的新闻分析: CNN。(2021年)CDC的数据显示,超过99.99%的完全接种疫苗的人没有出现严重的突破性病例。https://edition.cnn.com/us/live-news/coronavirus-pandemic-vaccine-updates-08-09-21/h_9c6a79bada1c3b54c7d873635394a789